Gødningsanvendelsesbekendtgørelsen regulerer jordbrugsvirksomheders anvendelse af især organisk gødning men også af andre gødningstyper på arealerne. Bekendtgørelsen fastsætter regler til beskyttelse af miljøet mod næringsstofpåvirkninger og til beskyttelse af naboer mod gener fra anvendt gødning. Størstedelen af udkastet til gødningsanvendelsesbekendtgørelse er genudstedelse af den gældende bekendtgørelse (nr. 1025 af 30/06/2023). De væsentligste ændringer følger af, at Danmarks undtagelse fra nitratdirektivet (kvægundtagelsen) udløber. Fra planperioden 2024/2025 vil det derfor ikke længere være muligt for jordbrugsvirksomheder at få tilladelse til at udbringe op til 230 kg kvælstof fra organisk gødning, herunder husdyrgødning, pr. hektar harmoniareal. Jordbrugsvirksomheder, der tidligere har anvendt kvægundtagelsen skal fremover følge den almindelige regel om, at der maksimalt må udbringes 170 kg kvælstof fra organisk gødning, herunder husdyrgødning, pr. hektar harmoniareal. Ændringen betyder også, at disse jordbrugsvirksomheder skal overholde de almindelige fosforlofter. Desuden indføres krav om, at tilsætning af ureasehæmmer til kunstgødning med ureabaserede kvælstofforbindelser kun må ske ved brug af en CE-mærket ureasehæmmer.